Secara administratif pemerintahan Balai Taman Nasional Komodo termasuk dalam wilayah Kecamatan Komodo, Kabupaten Daerah Tingkat II Manggarai, Propinsi Nusa Tenggara Timur. Sedangkan secara geografis, kawasan ini terletak diantara Pulau Flores (Propinsi Nusa Tenggara Timur) dan Pulau Sumbawa (Propinsi Nusa Tenggara Barat). » lihat profil